業績
著書および訳書
第1部Topics2：人工林の現状と問題点, 第2章Topics3：森林管理の歴史, 第二部第1章：調査の10年, Topics5ネズミの好きな森, 第3章：人材育成の10年, 「土岐川・庄内川源流 森の健康診断―恵那の森からの学び―」, Acta（26）, 上野薫・南基泰 編著, 分担執筆14-16, 20-22, 24-32, 36-37, 50-56, 風媒社, 2016年3月
第2章生物を取り巻く環境, 第3章生物環境中の物質循環, 第4章地球規模の環境変動, 「環境生物学序論 改訂版」, 南基泰・上野薫・山木昭平編, 分担執筆80-104, 106-121, 124-136, 風媒社, 2015年4月
キノコ生産の隠れた廃棄物問題とその解決策, 「ESD自然に学び大地と生きる」, Acta（23）, 宗宮弘明・南基泰 編, 分担執筆94-104, 風媒社, 2014年11月
第2章生物を取り巻く環境, 第3章生物環境中の物質循環, 第4章地球規模の環境変動, 「環境生物学序論」, 南基泰・山木昭平編, 分担執筆71-96, 97-111, 113-125, 風媒社, 2013年5月
酸性硫酸塩土壌と農地利用, 「農地環境工学」, 分担執筆299‐302, 文永堂出版, 2008年10月
学術論文、評論
Tomoyasu Shirako, Yusuke Ishizawa, Yui Ajioka, Makiko Aichi, Kaoru Ueno, Do Tan Hoa, Bach Thanh Hai, Tran Van Thanh, Masaaki Yamada and Motoyasu Minami, Identification of Muridae Species and Their Food Resources Using DNA Barcoding in Cat Tien National Park, Vietnam, Mammal Study 40(4):217-229, 2015 Dec.
白子智康, 愛知真木子, 上野薫, 南基泰, 葉緑体DNArbcL遺伝子によるアカネズミおよびヒメネズミ糞中植物種残渣推定, 哺乳類科学54（1）：95-101, 2014年6月.
白子智康, 愛知真木子, 上野薫,南基泰, ミトコンドリアDNA D-loop領域多型解析による岐阜県乗鞍岳麓におけるネズミ科3種の遺伝的構造解析, DNA多型学会22（1）：16-20, 2014年7月.
小林信介, 浜辺久, 李延亮, 板谷義紀, 上野薫, 二宮善彦, 下水汚泥の堆肥化乾燥における汚泥炭化物混合の影響, 化学工学論文集, 40, 1-6, 2014年7月.
白子智康, 石澤祐介, 上野薫, 南基泰, 愛知県弥勒山におけるアカネズミとヒメネズミの遺伝的構造の相違, 環境アセスメント学会誌12（2）：72-84, 2014年8月.
愛知真木子, 味岡ゆい, 上野薫, 寺井久慈, 南基泰, 東海丘陵要素植物群の無機窒素栄養に対する種特異性, 日本湿地学会, 湿地研究, Vol.3, 3-14, 2012年.
上野薫, 大畑直史, 久保壮史, 寺井久慈, 南基泰, 小田原卓郎, 那須守, 米村惣太郎, 横田樹広, 環境アセスメント学会誌9（1）, 73-84, 2011年3月.
中村沙耶香, 味岡ゆい, 上野薫, 寺井久慈, 南基泰, 横田樹広, 那須守, 小田原卓郎, 米村惣太郎, 岐阜県東濃地方の土岐砂礫層湿地におけるヒメタイコウチ（Nepa hoffumannni）のHSIモデルの構築, 環境アセスメント学会誌9（1）, 58-63, 2011年3月.
味岡ゆい, 愛知真木子, 上野薫, 寺井久慈, 南基泰, 米村惣太郎, 那須守, 横田樹広, 小田原卓郎, 2007-2009年に構築したハルリンドウHSIモデルの年間比較, 環境アセスメント学会誌9（1）, 64-72, 2011年3月.
杉井俊夫・南基泰・上野薫・松原祥平, 植生及び地質・地形からみた森林の浸透環境―森の健康診断から浸透マップの構築―, 地盤工学会誌, Vol.58, No.9, 14-17, 2010年9月.
味岡ゆい・斎藤裕子・上野薫・寺井久慈・南基泰・米村惣太郎・那須守・横田樹広・小田原卓郎, HSIモデルを用いたハルリンドウ（Gentiana thunbergii）の遺伝的多様性保全のための環境要因評価, 環境アセスメント学会誌8（1）62-73, 2010年2月.
Kaoru Ueno, Tadashi Adachi and Hajime Narioka, Population Dynamics of Thiobacillus ferrooxidans in Different Soil Moisture Conditions of a Pyritic Soil, Journal of the Japanese Society of Soil Physics, 71-78, 2006 March.
上野薫, 足立忠司, 成岡市, 酸性硫酸塩土壌の水分状態が土壌呼吸活性に及ぼす影響, 土壌の物理性（93）, 35-45, 2003年3月.
上野薫, 足立忠司, 成岡市, 微生物的観点からみた酸性硫酸塩土壌の研究史, 土壌の物理性（92）, 31-39, 2003年3月.
上野薫, 足立忠司, 成岡市, 児島湖底堆積土の酸性化過程における温度・水分条件の影響, 土壌の物理性（91）, 15-23, 2002年7月.
上野薫, 足立忠司, 成岡市, 酸性硫酸塩土壌の乾燥過程が微生物活性および鉄の形態に与える影響, 土壌の物理性（91）, 49-57, 2002年7月.
講演、シンポジウム、学会発表
山田浩輔・松浦大悟・森遼介・南基泰・上野薫, 北アルプス太郎山周辺におけるニホンライチョウ雛のGISを用いたハビタット解析, 野生生物と社会学会, 2017年11月, 帯広畜産大学（ポスター発表）
松浦大悟・山田浩輔・高須富美子・南基泰・上野薫, 北アルプス太郎山周辺におけるニホンライチョウ雛の7月の採食資源, 野生生物と社会学会, 2017年11月, 帯広畜産大学（ポスター発表）
Kaoru Ueno, Hisashi Hamabe, Facun Jiao, Zhongbing Dong, Yoshihiko Ninomiya, Biochemical process of drying wet biomass OKARA using aerobic fermentation additioned sludge char, The 20th International Drying Symposium, Gifu, Japan (poster), 2016 Aug.
Yoshihiko Ninomiya, Juan Chen, Kaoru Ueno, Tomoaki Namioka, Naoomi Yamada, Mikio Kumita, Hitoaki Hirayama, Tatsuro Harada, Agglomerate Formation of Coal Ash and Limestone in Bubbling Fluidized Bed Combustor, The 22nd International Conference on Fluidized Bed Conversion previously “International Conference on Fluidized Bed Combustion”, 756-763, Turku, Finland (oral and short paper), 2014 Jun.
Kohei Seike, Masaaki Eguchi, Kaoru Ueno, Analysis of bacterial community structures in slow sand filtration bed on different region and soil depth by PCR-DGGE method, The 5th International Slow Sand and Alternative Biological Filtration Conference, Nagoya, Japan, 2014 Jun(poster). Progress in slow sand and alternative biofilteration processes, 91-95, IWA Publishing, London, 2014 Jun.
Kaoru Ueno, Tadashi Adachi, Influence of Soil Moisture on Microbial Activity in a Primary Acidification of Pyritic Soils, 2004 AGU Fall Meeting, San Francisco, USA(poster).
